从零开始入门python深度学习（一）：python和pycharm的安装，认识pycharm

前言

生信作曲家一直致力于构建国内和谐、开放、可持续的生物信息交流平台。生信作曲家的目标是为每个科研人扫清科研路上的一切障碍，让生物信息学人人可做。目前，生信作曲家已推出"跟着一区文章学通机器学习"，"跟着一区文章学通单细胞"，Bootstrap，CIBERSORTx, NTP, TICPE，metaVIPER算法等多种强力教程，同时也兼具GEO数据库，ICGC数据库数据整理等核心入门技术教学，开办7天发文A计划，五一创新发文计划pro，生信中秋分享会、小年夜分享会、暑期集训营和冬季集训营等多次。辅导同学实现纯生信SCI发表硕果累累。

关于python和深度学习的教程已经屡见不鲜了，生信作曲家从本辑开始将致力于推广可以被普通的医学科研人员所接受的python深度学习教程。本教程使用的框架是keras，运行载体是pycharm，基础教程的部分参考《深度学习：基于Keras的Python实践（魏贞原）》一书，有兴趣的读者可以更进一步参考。所使用的案例基本也是医学相关的案例。我们将从神经网络基础出发，一步步深入到医学影像系统的识别。

本节，我们将进入python和pycharm的安装，如果你从未使用过，需要在下一节开始前完成它们的安装。当然，本节内容你需要检索更多的pycharm使用教程，这些在网络上已经是太多了。

熟悉环境

认识界面

下载好python和pycharm后，你可以看到如下的界面

推荐使用pycharm是因为它能像Rstudio一样看到你所有的运行内容。使用anaconda的jupyter notebook可能导致长期使用Rstudio的同学不适应

1. python project，pycharm必须创建project才可运行，并且不同project的库实际上是不通用的。例如此处的project1的名字是machinelearning

2. 脚本区

3. 控制台，显示进程

4. 显示已创建的变量，相当于R的environment

5. 安装包区，点击即可进入装包的窗口

常见安装问题

关于pycharm的使用已经有太多教程了，具体安装步骤可通过检索，针对一些报错我们作如下的介绍

Q1：pycharm提示python版本不对怎么办？明明已经安装了3.10的python

想使用python 3.10.4，安装了以后，打开pycharm设置后，出现unsupported python 3.1,折腾了一会发现，不是因为python没装对，是因为pycharm版本低了

报错图片：

解决方案：

下载pycharm 2021.3.3

Q2：python安装包很慢怎么办？

如同R一样，需要设置清华源或者豆瓣源的镜像，具体实施可通过检索，如图我配置了清华源的镜像，装包就快了

Q3：如何解决新建project后包都不在了?

引用自：https://blog.csdn.net/hu706789355/article/details/122784852，可学习

Q4:  什么是python解释器？怎么切换

解释器(interpreter)：可以理解为，读懂你的python代码的机器，解释器的类型要与python代码的版本(版本就是常说的3.x 2.x。。。)对应。

切换解释器：用哪个python.exe的环境，主的？还是该项目的？

Q5：有些包安装了还是不能用怎么办？

版本问题，可能导致虽然下载但没用

pip install ipython==7.11.0

可以指定版本安装（后复制到指定project lib文件夹下